Si je peux me permettre...
pour la conversion video, VLC le fait très bien
Oui mais d'après mes tests (anciens...) ça fonctionne mieux sous Windows.
Avec Linux la conversion est basée sur ffmpeg et, tout comme en utilisant ffmpeg directement, j'ai en général des fichiers sans vidéo dedans.
Ca dépends peut-être de la distribution ou de ce qu'il y a entre la chaise et l'écran...
Ceci dit je l'utilise au boulot et avec succès avec la version Framakey.

pour l'audio (service menu sous KDE) : audiokonverter, parfait aussi
Tout à fait. J'avais oublié

C'est parceque je pensais plutôt au scénario suivant :
J'ai encodé mon DVD de "Ne le dis à personne" en AVI à l'aide de (examples) Dvdrip parceque je trouve ce film trop bien et que je veux être sur d'en garder une copie.
Et comme j'adore le final musical (écrit par M) j'ai acheté le CD contenant la musique du film.
Mais voilà sur le CD le morceau qui m'interesse est très "épuré" et me plait moins.
Alors hop j'extraie la bande son de mon AVI avec Avidemux et je découpe/encode la partie qui m'interesse avec Audacity.
Voili, voilou... c'était juste pour en parler...